Conhecendo as principais bactérias do microbioma
O microbioma intestinal é composto por bactérias, archaea, vírus e organismos eucarióticos que residem no trato gastrointestinal (TGI) e que se relacionam com o hospedeiro de forma simbiótica (simbiose: associação a longo prazo entre dois organismos de espécies diferentes).
Estima-se que o número de micróbios instestinais superem em cerca de 10 vezes o número de células presentes no hospedeiro (Suchodolski, 2011).
Grandes grupos de bactérias
O microbioma fecal de cães saudáveis é co-dominado por três grandes grupos (filos): Firmicutes, Bacteroidetes e Fusobacterium (Middelbos et al.,2010; Hand et al., 2013).
Dentro destes grupos, muitas bactérias pertencem ao filo Firmicutes. A classe bacteriana Clostridia está consistentemente dentro das bactérias mais abundantes, dominados por três grupos de Clostridium: IV (por exemplo, família Ruminococcaceae, Faecalibacterium prausnitzii), XI (por exemplo, família Peptostreptococcaceae) e XIVa (por exemplo, família Lachnospiraceae, Blautia spp.) (Vazquez-Baeza et al., 2016; Handl et al., 2011; Garcia-Mazcorro et al., 2012). Além de Clostridia, outras classes prevalentes dentro do filo Firmicutes são Bacilli e Erysipelotrichi. A classe Bacilli consiste quase exclusivamente da ordem Lactobacillales, dominada pelos gêneros Streptococcus e Lactobacillus. A classe Erysipelotrichi compreende principalmente os gêneros Turicibacter, Catenibacterium e Coprobacillus (Garcia-Mazcorro et al., 2011; Garcia-Mazcorro et al., 2012).
Bacteroidetes é outro filo abundante em amostras fecais de cães, compreendendo os gêneros Prevotella, Bacteroides e Megamonas (Garcia-Mazcorro et al., 2012; Hand et al., 2013).
Dentro do filo Fusobacteria, o gênero Fusobacterium está associado a cães saudáveis. Curiosamente, em humanos, o Fusobacterium está associado a doenças gastrointestinais, indicando que o Fusobacterium desempenha um papel diferente no TGI de cães (Vazquez-Baeza et al., 2016). A abundância de Fusobacterium é aumentada em cães com acesso ao ar livre (Song et al. 2013).
Os filos Proteobacteria e Actinobacteria também são comumente identificados. As actinobactérias também estão associadas ao intestino delgado e incluem as famílias Corynebacteriaceae (por exemplo, Corynebacterium spp.) e Coriobacteriaceae (por exemplo, Collinsella spp.) (Honneffer et al., 2017). Esses filos são tipicamente colonizadores do intestino delgado e normalmente se apresentam em menor número nas amostras fecais. Maiores quantidades dessas bactérias nas fezes estão geralmente associadas a doenças.
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Escrito por Flavio O. Francisco, PhD.
Mais informações nos artigos abaixo
Garcia-Mazcorro JF, Dowd SE, Poulsen J, Steiner JM, Suchodolski JS.2012. Abundance and short-term temporal variability of fecal microbiota in healthy dogs. Microbiologyopen. 1: 340–347. doi: 10.1002/mbo3.36
Garcia-Mazcorro JF, Lanerie DJ, Dowd SE, Paddock CG, Grutzner N, Steiner JM, et al. 2011. Effect of a multi-species synbiotic formulation on fecal bacterial microbiota of healthy cats and dogs as evaluated by pyrosequencing. FEMS Microbiol Ecol. 78: 542–54. doi: 10.1111/j.1574-6941.2011.01185.x
Hand D, Wallis C, Colyer A, Penn CW. 2013. Pyrosequencing the canine faecal microbiota: breadth and depth of biodiversity. PLoS ONE 8: e53115. doi: 10.1371/journal.pone.0053115
Handl S, Dowd SE, Garcia-Mazcorro JF, Steiner JM, Suchodolski JS. 2011. Massive parallel 16S rRNA gene pyrosequencing reveals highly diverse fecal bacterial and fungal communities in healthy dogs and cats. FEMS Microbiol Ecol. 76: 301–310. doi: 10.1111/j.1574-6941.2011.01058.x
Honneffer JB, Steiner JM, Lidbury JA, Suchodolski JS. 2017. Variation of the microbiota and metabolome along the canine gastrointestinal tract. Metabolomics 13: 26. doi: 10.1007/s11306-017-1165-3
Middelbos IS, Vester Boler BM, Qu A, White BA, Swanson KS, Fahey GC Jr. 2010. Phylogenetic characterization of fecal microbial communities of dogs fed diets with or without supplemental dietary fiber using 454 pyrosequencing. PLoS ONE 5:e9768. doi: 10.1371/journal.pone.0009768
Rachel Pilla, R, Suchodolski J.S. 2020. The Role of the Canine Gut Microbiome and Metabolome in Health and Gastrointestinal Disease. Frontiers in Veterinary Science, 6. https://doi.org/10.3389/fvets.2019.00498
Suchodolski JS. 2011. Intestinal microbiota of dogs and cats: a bigger world than we thought. Vet Clin North Am Small Anim Pract. 41:261–72. doi: 10.1016/j.cvsm.2010.12.006
Vazquez-Baeza Y, Hyde ER, Suchodolski JS, Knight R. 2016. Dog and human inflammatory bowel disease rely on overlapping yet distinct dysbiosis networks. Nat Microbiol. 1:16177. doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.177
